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项目文章一览2019-08-21T13:41:32+00:00

今天小编通过解读一篇发表在Cell Rep上的文章,来给大家讲一下八分的单细胞测序文章都做了哪些事?流程是什么样的?助你轻松上手单细胞测序!

多组学联合分析是指对来自不同组学,如基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学的数据进行统一处理、比较分析应用到同一课题中。

近年来中医药的研究慢慢开始兴起,竟然登上了Nature头条。2018年9月26日,Nature头条刊登了一篇名为“Why Chinese medicine is heading for clinics around the world”的新闻,报道了中医诊所正在世界各地兴起,且世界卫生组织(WHO)首次认可传统医学。

本篇文章( An Interferon-independent lncRNA promotes viral replication by modulating cellular metabolism)由第二军医大学医学免疫学国家重点实验室、中国工程院院士曹雪涛、王品副教授研究团队发表,报道了非编码RNA(lncRNA-ACOD1)通过结合细胞内代谢酶GOT2调控胞内代谢促进病毒逃逸的新发现。

简单总结一下这篇文章里用到的分析策略:DNA SV分析、融合基因分析  CNV分析、微同源缺失的评估、chromothripsis and chromoplexy 的评估、突变特征分析 、非编码基因的突变分析。

三阴乳腺癌约占乳腺癌的 10%-15%,可能对新辅助化疗有反应,但通常会产生耐药性。研究人员利用单细胞DNA和RNA测序的联合分析对三阴性乳腺癌(TNBC)在基因组和转录水平上的药物抗性的进化轨迹,从而研究清楚基因突变是原先存在的还是化疗诱导耐药标志物转录的。这些研究将对这种癌症的诊断、预后和治疗具有临床意义。

癌症关联的巨噬细胞TAMs的强烈渗透作用能刺激脑胶质瘤GBM的恶性生长,但其机理不明;本文通过研究发现TAMs细胞通过分泌大量的多效生长因子PTN能够与胶质瘤干细胞GSCs上的受体PTPRZ1结合,激活PTN-PTPRZ1旁分泌信号途径,刺激胶质瘤干细胞向恶性胶质瘤的转化,同时,研究结果证明抑制PTN表达或阻断PTPRZ1受体都能极大的降低恶性胶质瘤的生长

全外显子组测序(WES):一种利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。由于其能以相对较低的检测成本,获得更加可靠的突变,创造更多的临床价值,受到了越来越多学者的喜爱,成为遗传病诊断的新秀

以后要上Nature的细胞数要求起码是百万级别的了。只做十万不到细胞数的文章怕是已经上不了10分了。

近几年,ceRNA的研究可谓是如火如荼,各种高分文章满天飞,到了18年热度依旧不减,今年国自然中标45项,中标金额为:1818万。

单细胞测序以单个细胞为单位通过全基因组或转录组扩增进行高通量测序,能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。其在肿瘤、发育生物学、神经科学等领域有重要应用,是现今生命科学研究的焦点。

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