高通量测序技术

 

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变。

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mRNA测序

Illumina提供的mRNA测序技术可在整个mRNA领域进行各种相关研究和新的发现。mRNA测序不对引物或探针进行设计,可自由提供关于转录的客观和权威信息。研究人员仅需要一次试验即可快速生成完整的poly-A尾的RNA完整序列信息,并分析基因表达、cSNP、全新的转录、全新异构体、剪接位点、等位基因特异性表达和罕见转录等最全面的转录组信息。

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lncRNA测序

lncRNA测序采用Illumina HiSeq平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的lncRNA鉴定和lncRNA靶基因预测,同时提供针对测序数据中mRNA的分析,结果更全面,广泛应用于医学、农学研究领域。

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转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

miRNA测序

Small RNA(sRNA)测序采用Illumina HiSeq平台,可针对样本中的miRNA、siRNA、piRNA展开全面分析,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA并预测sRNA的靶基因,为研究small RNA功能及调控机制提供有力手段。

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circRNA测序

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类特殊的非编码RNA,其具有很多重要的调控功能。circRNA可作为竞争性内源RNA(ceRNA)结合胞内miRNA阻断miRNA对其靶基因的抑制作用,还可调控其他类型RNA、调节蛋白质活性等。circRNA的环状结构对RNase不敏感,导致它比线性RNA更为稳定,这些特性使得circRNA具有开发疾病新型诊断与治疗方法的巨大潜力。

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外泌体(Exosome)是由包括肿瘤细胞在内的几乎所有类型的细胞都可以产生并释放的一种微囊,其内部包裹了DNA,RNA,蛋白等物质。众多的研究表明,外泌体在血液,乳汁,尿液等体液内传播,越来越多的证据表明,宿主细胞或肿瘤细胞分泌的外泌体参与了肿瘤发生、生长、侵袭和转移。

外泌体上述特征和生物学功能,使其成为液体活检领域的重要研究对象,利用转录组高通量测序技术可以同时检测其所含RNA分子如lncRNA,mRNA,对外泌体mRNA、lncRNA等的鉴定和调控功能进行研究。

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人全基因组重测序是对人类个体进行全基因组测序,扫描整个人基因组上可能发生的变异,可全面挖掘基因组的SNP/InDel/CNV/SV等各类变异。全基因组重测序可为筛选疾病的致病及易感基因,研究发病及遗传机制提供重要信息。

上海其明利用illumina高通量测序平台进行人全基因组重测序,用生物信息学分析不同个体基因组间的差异, 并通过多个基因组变异相关数据库的注释,帮助您在全基因组水平上扫描并检测特定人群的重要遗传性状相关位点。

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人全外显子组测序是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域DNA富集后再进行高通量测序的方法。相比于全基因组测序,外显子组测序的检测目标更明确,测序深度更高,研究更经济高效。

人全外显子组测序主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的编码区及UTR区域内的结构变异。结合大量的公共数据库提供的外显子数据,有利于更好地解释所得变异结构之间的关联和致病机理。

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全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina HiSeq高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究。上海其明以新一代高通量测序平台HiSeq X Ten为基础,进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制,从而帮助您在细胞分化、组织发育等基础机制研究以及人类健康与疾病研究奠定基础。

为什么选择其明测序

仪器与试剂

先进设备&原装试剂确保实验室结果无误差

  • 其明生物实验室成立于2004年,规模达650㎡
  • 拥有Affymetrix、Thermo、Roche、Covaris、ABI、Eppendorf、Rainin等多家原厂高端设备
  • 使用原厂原装试剂盒和耗材进行实验,实验结果精准!

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部分相关合作文献

客户单位 期刊名称 文章标题 影响因子
1.北京首都医科大学附属北京天坛医院神经外科2.山东省钱福山医院检验科3.首都医科大学附属北京神经外科研究所神经外科 Oncotarget Altered microRNA profiles in plasma exosomes from mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis. 5.008
1.苏州大学附属第一医院心血管外科,苏州大学心血管病研究所2.日本神奈川县东海大学医学部再生医学系 J Am Heart Assoc Pretreatment of Cardiac Stem Cells With Exosomes Derived From Mesenchymal Stem Cells Enhances Myocardial Repair. 5.117
1.山东省医学科学院,山东省医药生物技术中心,卫生部生物技术药物重点实验室 FEBS Lett Exosomes derived from mineralizing osteoblasts promote ST2 cell osteogenic differentiation by alteration of microRNA expression 3.519